- Руководитель проекта : доктор Лешек Прищ, Международный институт молекулярной и клеточной биологии в Варшаве
- Название проекта : Расшифровка роли редактирования РНК в развитии рыбок данио.
- Конкурс : POLONEZ 1, объявленный 15 сентября 2015 года.
- Панель: NZ 2
Центральная догма молекулярной биологии и редактирования РНК. Источник из Википедии под лицензией Creative Commons (автор: Михал Собковски). Модифицировано Лешком Прищем.
Редактирование РНК (также называемое редактированием РНК) - это процесс посттранскрипционных изменений РНК. Таким образом, этот процесс противоречит центральной догме молекулярной биологии о передаче информации от гена (ДНК) через транскрипт (РНК) к белку (рис. 1). Отдельные азотистые основания РНК могут быть вставлены (добавлены), удалены (удалены) или они могут быть превращены в другие основания дезаминированием, например, аденозин в инозин (A → I) или цитидин в урацил (C → U). Ферменты из двух семейств: ADAR и APOBEC ответственны за катализирование этого процесса у позвоночных.
Редактирование РНК впервые было описано в 1980-х годах. Роль этого процесса была характерна для многих видов животных и растений. Мы знаем, что это влияет как на физиологию, так и на поведение животных от насекомых до млекопитающих. Кроме того, этот процесс является одним из механизмов защиты от РНК-вирусов и экспансии мобильных элементов (т.е. ретротранспозонов Alu), происходящих среди других в геноме человека.
В своем исследовании я сосредоточился на понимании функции редактирования РНК в раннем эмбриональном развитии позвоночных. Этот механизм исследуется с использованием рыбы-рыбы-зебры ( Danio rerio ), которая является одной из моделей развития позвоночных благодаря простоте содержания взрослых и возможности получения эмбрионов в больших количествах. Белки семейства ADAR находятся как в яйцеклетке, так и в зародышевом развитии рыбы. Интересно, что недостаток этого белка вызывает значительные нарушения в раннем развитии рыб (рис. 2). Изменения видны уже после трех часов оплодотворения, и эмбрионы, у которых нарушен этот белок, не выживают в первый день.
Отредактированные азотистые основания РНК можно обнаружить путем сравнения последовательности транскриптов и генов, из которых они были получены, с использованием секвенирования следующего поколения (NGS). Таким образом, мы смогли охарактеризовать стенограммы, которые редактируются ADAR. Многие из них являются ключевыми регуляторами раннего развития, отвечающими, среди прочего, за правильное определение передней и задней оси тела. Детальное понимание роли редактирования РНК в раннем развитии позвоночных будет способствовать лучшему пониманию регуляции экспрессии генов в эмбриональном развитии.
Я провожу свои исследования каждый день в Лаборатории геномики данио в MIBMiK в Варшаве, которой руководит д-р Сесилия Винат. Стажировка в программе POLONEZ, в дополнение к доступу к новейшим методам молекулярной биологии и личностному развитию, позволила мне сотрудничать с учеными со всего мира.
доктор Лешек Прищ
фото: Михал Лепецкий
Он очарован его ранними подростками. Получив степень бакалавра в области биотехнологий в Силезском университете в Катовице, он отправился в Великобританию, где в 2009 году получил степень магистра биоинформатики в Йоркском университете с отличием. Однако настоящим началом научного приключения является этап PhD. В 2009 году он получил престижную стипендию La Caxia для обучения в докторантуре в Университете Помпеу Фабра в Барселоне. Проект доктора философии был осуществлен в лаборатории сравнительной геномики доктором Тони Габалдоном, в знаменитом Центре геномной регуляции (CRG). В 2015 году он начал работать в Международном институте молекулярной и клеточной биологии в Варшаве, где с 2017 года он реализует проект, финансируемый в конкурсе POLONEZ 1.
Помимо обучения, он активно участвует в обмене знаниями и навыками с научным сообществом. Он основатель #NGSchool , некоммерческая организация, которая организует летние курсы и биоинформатику с 2016 года.
Дата публикации: 15/11/2018